Действие романа "Царство Агамемнона" происходит не в античности - повествование охватывает XX век и доходит до наших дней, - но во многом оно слепок классической трагедии, а главные персонажи чувствуют себя героями древнегреческого мифа.
Герой-рассказчик Глеб занимается подготовкой к изданию сочинений Николая Жестовского - философа и монаха, который провел много лет в лагерях и описал свою жизнь в рукописи, сгинувшей на Лубянке. Глеб получает доступ к архивам НКВД-КГБ и одновременно возможность многочасовых бесед с его дочерью. Судьба Жестовского и история его семьи становится основой повествования.